Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKACBP22694 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms