Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms