Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZNF35P13682 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF35P13682 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF35P13682 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF35P13682 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF35P13682 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF35P13682 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms