Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms