Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUP10909 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUP10909 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUP10909 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms