Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms