Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFLP07196 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFLP07196 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFLP07196 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFLP07196 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFLP07196 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms