Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCC9O60706 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ABCC9O60706 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms