Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms