Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER2I3L3R5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER2I3L3R5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms