Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W031 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W031 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W031 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W031 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
F8W031 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W031 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W031 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
F8W031 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.33■■□□□ 1
F8W031 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8W031 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
F8W031 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F8W031 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
F8W031 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W031 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W031 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8W031 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
F8W031 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms