Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOLGA6L9A6NEM1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOLGA6L9A6NEM1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms