Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms