Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC162PA2VCL2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms