Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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