Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP3Q9Y3E7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP3Q9Y3E7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms