Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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