Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
L1RE1Q9UN81 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
L1RE1Q9UN81 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms