Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80Q9ULG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms