Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK4Q9UBT3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms