Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms