Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms