Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB4Q9NTQ9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms