Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DLL4Q9NR61 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms