Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KIAA1549Q9HCM3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms