Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf88Q9H8K7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms