Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRRTQ9BXP5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms