Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP58Q9BVL2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms