Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms