Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms