Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UTP23Q9BRU9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms