Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM83CQ9BQN1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms