Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGIP1Q9BQI5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms