Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms