Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP4Q99569 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms