Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SORT1Q99523 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORT1Q99523 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms