Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCLRE1CQ96SD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms