Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRP3Q96P20 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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