Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227BQ96M60 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms