Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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