Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms