Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFKQ969G6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms