Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRG4Q92954 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms