Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRAT1Q92837 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRAT1Q92837 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms