Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG16L2Q8NAA4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms