Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP1Q86WV1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP1Q86WV1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms