Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms