Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms