Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NLRP9Q7RTR0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms