Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms